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  • 2022-06-16 14:42:15 发布

使用 sequin 批量提交序列图解教程(by raindy)

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FujianAgricultureandForestryUniversity生信系列课件Sequin 批量提交序列AgraphicguideforSequintosubmitsequence(内部交流)Raindyok@qq.com2012.12 准备工作•序列文件•序列信息•联系信息 序列文件•格式必须是FASTA,扩展名不限;•序列内容只有含有常见的五种碱基字母(A/C/T/G/U) 序列信息SeqIdOrganismIsolateCountryCollection-dateHostXQ2PotatovirusYXQ2China30-Mar-2011SolanumtuberosumXQ3PotatovirusYXQ3China30-Mar-2011SolanumtuberosumXQ4PotatovirusYXQ4China30-Mar-2011SolanumtuberosumXQ5PotatovirusYXQ5China30-Mar-2011SolanumtuberosumXQ8PotatovirusYXQ8China30-Mar-2011SolanumtuberosumXQ9PotatovirusYXQ9China30-Mar-2011SolanumtuberosumXQ10PotatovirusYXQ10China30-Mar-2011SolanumtuberosumXQ11PotatovirusYXQ11China30-Mar-2011Solanumtuberosum相关信息(Organism、Isolate、Country、Collection-date、Host)注意:列(column)之间的界定符号是Tab符,不是空格。 联系信息联系方式 联系信息(续上)完整填写后,可以导出为模板单位通讯地址 启动Sequin开始操作… 1启动序列提交读取保存的已有提交记录 2设置序列发布日期,默认是接收后立即发布3导入联系方式模板 4使用常规的提交向导 5批量提交 6导入预先准备的序列文件(FASTA格式) 7导入预先准备的序列信息 8序列注释9CDS为编码区信息10批量添加序列的定义行,并添加前缀11 16全部修改完成,点此12修改编码区信息,双击即可弹出窗口,修改相关信息 13修改编码区位置1415接受修改 提交前,最好验证一下提交序列是否有重要错误,并根据提示修改!17验证提交文件是否存在明显错误? 18主要检查Error、Reject是否有明显错误 19准备提交 20提示保存*.sqn文件,作为附件提交 正式提交,将生成*.sqn文件作为附件,并简要说明一下所提交的序列的简要信息,发到gb-sub@ncbi.nlm.nih.gov 《Sequin 批量提交序列》http://t.qq.com.cn/raindyE-mail:raindy@fafu.edu.cnorraindyok@qq.comNetdisk:http://raindy.ys168.com